根据新形势的要求，1964年1月3日国防部发布第01/QP-QD号决定，将海军部升级为海军军种，部指挥委员会升级为军种指挥部，任务为：“指挥和领导海军军种的建设，在北方的空域、海上和海岸实施作战行动”。这是海军作为管理、保卫祖国主权和江河大海岛屿战场作战的主力力量，在组织规模和战斗力上迈上新台阶的重要事件。
海军部党委也升格为海军党委。参谋部、政治部、后勤部升格为总参谋部（1965年10月改称总参谋部），政治部、后勤部及机构编制相应统一。部队经过合并和组建以满足新的作战要求。
党委和军事指挥部积极指导保障战备作战的后勤、技术、手段和武器的工作。在此期间，海军在极其紧急的条件下同时履行多项使命，面对许多激烈的战争困难和挑战，却取得了许多辉煌的业绩，不断成熟和进步。
1964年8月2日至5日第一次战役胜利
美帝国主义为了挽救南方“特别战争”战略的失败，阴谋加紧侵略战争，把毁灭性的战争扩大到越南北方。面对新的形势，党中央和胡志明主席指示做好充分准备，坚决抵抗美帝国主义新的战争升级。
1964年8月5日，越南人民海军对美国飞机轰炸朝鲜进行反击。照片：国家历史博物馆
1964年4月，海军党委常委会召开会议，决定开展政治学习，深入学习贯彻胡志明主席的号召和中央军委、国防部“使一部分武装力量转入战争状态”的指示，使全体官兵、国防工作人员正确认识形势、新的任务要求，明确思想认识和责任，坚定决心，准备战斗并打败美国侵略者。全党贯彻“有令就要出动，有敌就要战斗；有什么任务就要干，有什么困难就要克服；有什么敌人就要战斗，有什么破坏就要战斗”的指导思想。
1964年6月，越南人民军总参谋长命令海军司令部将部队转入战时模式：“海军9年的和平建设就此结束。我们必须迅速将部队的一切活动和纪律转入战时模式。这对士兵来说是一次非常有利的训练机会，也是在现实中成长壮大的机会。 ” 1964年7月初，陆军党委常委召开扩大会议，全面掌握形势任务，决定全军转入战时状态，准备以最高战备水平对美机、美舰进行反击，不出意外、首战必胜。
1964年8月1日拂晓，海军观察所发现美国驱逐舰马多克斯号侵入广平海域并向北航行。
根据总参谋部的指示，1964年8月1日夜间，海军司令部下令使用鱼雷艇中队攻击敌方驱逐舰马多克号。
1964年8月2日，鱼雷艇第135大队第3中队（由3艘船组成，编号333、336、339），由中队长兼333号船船长阮春博同志指挥，奉命攻击敌舰。鱼雷艇队官兵以昂扬的战斗精神和战斗到底的决心，坚决惩治侵略者，勇敢地攻击和驱散敌舰，巧妙躲避敌火力，击伤“马多克”号驱逐舰，击落敌机一架，击伤一架，迫使敌舰逃离我国海域。
紧接着，美国当局又捏造“北部湾事件”，诬告越南海军故意攻击在国际水域航行的美国军舰，并以此为借口于1964年8月5日发动空袭，摧毁了越南人民海军在广平至广宁整个北部海岸的大部分基地、仓库、防空洞和海军力量。
基地和海军舰艇部队提前做好准备，保持高度警惕和战斗精神，与防空空军、武装部队和地方人民密切配合，英勇作战，击落敌机8架，击伤多人，并在北越海域俘虏了美国帝国第一位敌方飞行员（中尉飞行员安韦雷特）。
1964年8月2日击退马道克驱逐舰和1964年8月5日击退美国入侵飞机的壮举，体现了越南人民海军英勇的战斗精神、勇敢无畏和“敢于斗争、善于斗争、决心战胜”拥有比我们强大许多倍的经济、军事潜力和现代化武器装备的敌人的顽强意志，创造了越南人民海军和北方军民抗美救国战争的“第一次胜利”。
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