1949年4月，马鸿逵与马步芳因争夺西北王结下了仇，8月，阎锡山把二人请到广州进行调节。二马发誓，同心协力作最后抵抗，然而转身马鸿逵就给马步芳挖了一个大坑。
1949年4月，解放军都在做渡江战役准备了，西北二马：马鸿逵、马步芳却还在做着“西北王”的春秋大梦，还在为争夺西北军政长官和甘肃省主席之职闹得不可开交。
代总统李宗仁考虑到，在二马之中，不管委任哪一位，另一位都会有意见，干脆选了一个第三人：马鸿宾，结果马鸿逵第一个跳出来反对，说马鸿宾年老昏聩，“剿共”意志不坚定。
马步芳显然比马鸿逵要聪明，他不吵不闹，暗中派人携重金跑到广州，打通了白崇禧的门路，使得西北军政长官一职内定于他。
马鸿逵后知后觉，当得到消息后，为给自己一个台阶，就假装做个顺水人情，将军政长官一职让与马步芳，他说自己情愿当个参谋。
为缓和与马步芳紧张的关系，马鸿逵还将孙女许配给了马步芳兄长马步青的儿子做媳妇。
两马关系暂缓，很快达成一个约定，即马鸿逵主动放弃争夺西北军政长官一职，由马步芳出任，待马步芳上任后，再推举马鸿逵出任甘肃省主席。
马鸿逵之所以如此大度，主要他认为，“长官”是个虚职，“主席”才是实缺，等他当上甘肃省主席，就把宁夏省主席的大位让给儿子马敦静来做，这样一来，父子二人各掌一省，大权在握，便可推行甘、宁一体化，从而逐渐控制西北。
但他没有想到的是，马步芳言而无信，把他给耍了。马步芳当上西北军政长官后，马上就把甘肃省主席的大位送给了自己儿子马继援，再由亲信马骥出任青海省主席，推行的是甘、青一体化。
马鸿逵对此暴跳如雷，气得跑到广州找阎锡山理论，但阎精得跟个狐狸似的，怎会蹚这个浑水，只是表面敷衍一番了事。
马鸿逵不死心，又跑到台湾去找老蒋，在蒋面前哭诉。老蒋为拉拢他，承诺会“明令”发表他为甘肃省主席。
至8月初，果然老蒋兑现他的承诺，广州政府正式发表了马氏父子的职务，而且为了消除二人之间的矛盾，安抚他们一心做最后的抗战，阎锡山还把马鸿逵、马步芳请到广州，做了调停工作。
二马住在爱群酒店，秉烛夜谈，提到西北战况形势时，不禁抱头痛哭，似乎此刻共同的命运把他们真的拉到了一起。
然而在离开广州前，马鸿逵就召集全体部下，说决不能飞兰州，“如果我与马步芳同往兰州，必定会被扣押，然后他必强迫宁夏出兵，搞不好还会伤害我。我们若去兰州，不是送命给共产党，就是送命给马步芳。”
马鸿逵倒是吃一堑长一智，彻底认清了马步芳的嘴脸，但他却不明白唇亡齿寒的道理。8月20日，解放军将兰州城围了个水泄不通。
马步芳急得团团转，一个劲儿地向马鸿逵紧急求援，广州国民政府也是电报不断，催促他赶快派兵支援，但马鸿逵不为所动。
看着一封又一封的急电，他心里却乐开了花，得意地说：“我就不信放不倒你马步芳！”
但迫于形势，马鸿逵也不得不出兵敷衍一下，不过他的援兵走到甘、宁交界处就不走了，开始向马步芳要价，若马步芳不给军用物资，那就不走了，当然这么做，马鸿逵也有保存实力的因素。
结果马步芳独木难支，解放军用六天时间就拿下了兰州城。身在宁夏的马鸿逵听到消息后，没有半点悲鸣，反而哈哈大笑，认为自己报了马步芳耍弄他的一箭之仇。
二马死到临头，还在互相挖坑，不败才怪呢！
解放军拿下兰州后，就向宁夏的马鸿逵争取和平起义，但马鸿逵只是表面敷衍，对部下却说要誓死抵抗。
但战事一起，马鸿逵见形势不妙，马上就先溜了，带着两个姨太太跑去了重庆，后来两个儿子也相继去往重庆，父子三人相对而泣，却还希望留在宁夏的部下誓死效忠，结果他们选择了起义。
这个结果对马鸿逵来说，犹如晴天霹雳，他没想到，自己苦心经营多年的宁夏，就这样没了，好在他把大量财富早早运出来了。
再后来，二马都相继飞去台湾，马步芳父子一到，就在老蒋面前参了马鸿逵一本，给了马鸿逵一个“撤职查办”的处分。
不过马步芳也逃不脱对他的惩罚，随后“监察院”对二马发起弹劾案，要追究他们“贻误战机”的责任。
马步芳总是快马鸿逵一步，说他要去麦加朝觐，先溜去了中东，马鸿逵也自感在台呆不下去了，也效仿马步芳，随后跑去了香港。
在香港，他虽然过得也算惬意，但总觉得离台湾太近，心里不踏实，之后于1950年，在陈纳德的帮助下，领着家人跑去了美国。
为了赴美，他可是下了血本，把稀世珍宝翡翠西瓜都送给了陈纳德。到美后，马开办了一家“普拿马”牧场，以养马为业。
1970年1月14日凌晨，马鸿逵病逝于美国洛杉矶，享年78岁，死前他一直反复念叨着：“我死也要回去，我死也要回去。”，至死未入美国籍。
1971年1月，马的六姨太护送马鸿逵遗体返回台湾，最后安葬于台北县三张犁回教墓地，总算回到祖国的土地上。
