在本轮军改过程中，出现了个非常明显的变化，那就是军队各级司令部，相继改制为参谋部，例如军种司令部改制为了军种参谋部，大军区司令部改制为了战区联合参谋部。这是为什么呢？
在军改之前，军以上单位都设置了四大部，即司令部，政治部、后勤部和装备部。包括陆军集团军，省级军区，海军三大舰队，军区空军，大军区和军种机关。司令部是部队军事工作的中枢部门，位于四大部之首。
在七大军区时代，每个大军区都有军区司令部、军区政治部、军区后勤部（联勤部），和军区装备部，这4个机关单位。其中的军区司令部负责本军区的军事工作，军区里的各项军事事务，包括军事指挥、部队管理、情报搜集、应急处置、作战计划等，都由军区司令部具体负责。
本轮军改以后，七大军区改制为了五个战区，原七个大军区司令部，也改制为了五个战区联合参谋部。因此本轮军改后，不存在战区司令部这个说法，网上说某某战区司令部位于某某城市，完全是错得离谱。因为他们不知道战区联参部。
同理，军种司令部改制为了军种参谋部，集团军司令部改制为了集团军参谋部，海军舰队司令部改制为了海军舰队参谋部，军区空军司令部改制为了战区空军参谋部。
军改之前，军队各级司令部既负责军事作战，也负责部队建设，是“战建合一”的部门，不利于作战指挥，因此军改后被参谋部所取代。参谋部继承了司令部的核心职能，也就是指挥作战，而除了指挥作战职务的工作，则不由参谋部承担。
值得一说的是，军改后的军种参谋部，并不负责军种的军事指挥工作，而是负责军种的军事建设发展工作，以及战斗力培养等工作。
