在军改以前，我军的医疗保障机构，除了一个大名鼎鼎的解放军总医院之外，其实还设置有多种种类的总医院，比如在军种部队层面，有海军总医院、空军总医院、武警总医院等；在兵种部队层面，有二炮总医院；在大军区层面，有北京军区总医院、广州军区总医院等；在省级军区层面，有西藏军区总医院、新疆军区总医院。
其实，还有一类单位也有自己所属的总医院，便是解放军四总部。
自从1998年解放军总装备部成立后，我军就形成了总参、总政、总后、总装的四总部格局，作为全军的军事、政治、后勤、装备工作的最高领导机关，但奈何只有总参谋部和总装备部两个总部机关拥有以自己名称命名的总医院，分别是总参谋部总医院、总装备部总医院。
其中总参谋部总医院是半路改名转隶到总参麾下的，它的前身是总后勤部建制下的解放军309医院。
时间回到1958年，重庆的解放军41医院、武汉的解放军315医院跟南京军事学院附属医院合并，在位于北京的解放军122疗养院和解放军胸科医院的基础上，所成立的新的解放军309医院。
解放军309医院建成后，被列入了解放军总后方勤务部建制，即总后勤部，长达近50年时间，直到2004年5月，309医院的隶属关系和番号开始出现变化。
当时按照部队精简的要求，309医院从总后勤部直属转隶到总后勤部所下辖的解放军总医院管辖，并改称为解放军总医院309临床部，对外称呼为解放军总医院第二附属医院。至此，解放军309医院的番号基本走进了历史。
但无论再怎么改，解放军总医院309临床部的最顶层的隶属关系还在总后勤部，真正跨总部转隶的，还是在5年后。
2009年8月，解放军总医院第二附属医院转隶总参谋部，并改称为总参谋部总医院，从此309医院就从总后勤部过渡到了总参谋部，总参成立大半个世纪后，终于有了自己所属的总医院了，级别定为正师级单位。
遗憾的是，总参谋部总医院的番号存在的时间还不到10年，就遇到军改，随着四总部的撤销，总参总医院也不得不撤销番号，复称解放军309医院，暂时转隶到军委机关事务管理总局。随着军改的深化，309医院跟陆军总医院、武警总医院等诸多总医院一起，于2018年11月再次纳入了解放军总医院管辖，并改名为解放军总医院第八医学中心，顶层的隶属关系已经变成了解放军联勤保障部队。
相比总参谋部在2009年才拥有自己所属的总医院，总装备部拥有总医院的时间稍早一些。
总装备部总医院的前身是1971年创建的解放军国防科工委514医院，在总装备部成立前后，开始频繁更换名称。
先是在1997年1月改称为国防科工委总医院，当时国防科工委属于军政双重管辖的部门，主任都是大军区级上将，地位很高；
而后在1999年3月，国防科工委总医院改称为解放军306医院，这是因为国防科工委在1998年4月被拆分了，把国防科工委的装备职能跟总参装备部、总后负责装备的部门合并成立了总装备部，国防科工委其余的工业管理职能跟国家计委国防司的职能、以及各军工总公司承担的政府职能又合并成立新的国家国防科工委，不再隶属军委管辖，所以军事层面的国防科工委机关不存在了，国防科工委总医院只能改名称。
最后是在2000年4月，总装备部正式运行2年后，解放军306医院正式改编为总装备部总医院，级别定为正师级单位，这是四总部首个以自己名称命名的总医院，一直持续到军改，四总部撤销为止。
军改开启后，四总部全部被撤销了番号，同时又新成立了陆军领导机构、火箭军领导机构和享有军种地位的独立兵种——战略支援部队，总装备部总医院就顺势转到战略支援部队名下，改制为战略支援部队总医院。随着深改持续推进，在2018年战略支援部队总医院和空军总医院、火箭军总医院一样，没有被纳入解放总医院管辖，也没有改为第几医学中心，而是改称为战略支援部队特色医学中心，管辖权仍在战略支援部队。
但战略支援部队在2024年4月被撤销了番号，其下辖的战略支援部队特色医学中心也不得不撤番，移交给了解放军总医院，终究还是被改成了解放军总医院第九医学中心，级别仍是正师级。
比较特殊的是总政治部和总后勤部，却没有以自己番号命名的总医院，但这并不意味着它们没有自己的军医院。
其中总政治部有总政治部机关医院，创建于1960年，但它隶属解放军军事医学科学院，这是我军最高医学科研机构。
而总后勤部之所以没有“总后勤部总医院”，主要是因为总后勤部本来就属于后勤保障单位的领导机关，彼时已经下辖有包括解放军总医院在内的众多军医院，没必要再另设以总后勤部命名的总医院。
