康熙五十九年(1720年),康熙皇帝以自己的第十四子胤禵为抚远大将军,统率清军主力进攻青藏高原上的准噶尔军队,是为“驱准保藏”之战。与此同时,康熙还下诏给四川绿营兵名将岳钟琪,让其从四川打箭炉出发进攻拉萨,以策应胤禵的清军主力。岳钟琪充分发挥灵活机动的战术,长途奔袭,千里跃进拉萨,最终占据拉萨的准噶尔名将大策零敦多布不得不仓皇北逃,清军由此将西藏纳入大清帝国的版图。
战后,康熙对西藏进行了局部改革,如废除西藏第巴职位,另设噶伦(噶伦人数为4人,分别是康济鼐、阿尔布巴、隆布鼐、扎尔鼐,换言之就是将之前的权力一分为四,使之互相制衡)主持西藏政务。康熙六十年(1721年),康熙任命与忠于清廷的康济鼐为首席噶伦。而之前地位高于康济鼐的阿尔布巴却“靠边站”,其实清廷所以这样做就是要让康济鼐与阿尔布巴互相争斗,最终坐收渔翁之利。
果然,就在清军大军撤军后,阿尔布巴就开始联合隆布鼐、扎尔鼐另外2个实力派噶伦,与康济鼐进行明争暗斗。雍正五年(1727年)八月五日,阿尔布巴趁噶伦议事会议,在议事厅公然袭杀康济鼐,并派人追杀康济鼐的“铁杆盟友”颇罗鼐,因消息泄露,颇罗鼐有所察觉,才幸免于难。之后,颇罗鼐迅速将阿尔布巴叛乱的消息向雍正汇报,并组织部下讨伐阿尔布巴,是为阿尔布巴之乱,也叫卫藏战争。
雍正得悉阿尔布巴叛乱后,迅速召开御前会议,并指派内阁学士僧格、副都统马喇为驻藏大臣前去西藏调停,同时,诏命都察院左都御史查朗、护军都统迈禄和西宁镇总兵周开捷率军前往平叛。当清军往西藏进发的同时,颇罗鼐与阿尔布巴叛军的战事也是打的如火如荼,至雍正六年(1728年)五月,颇罗鼐已经取得了战争的主动权,在江孜和日喀则数败叛军主力,并率9000精锐,由自己和自己的儿子珠尔墨特车布兵分两路对拉萨发起钳形攻势。七月二日,颇罗鼐率部越过澎域山口,抵进拉萨近郊的喀巴一带。七月五日,颇罗鼐攻入拉萨,生擒阿尔布巴、隆布鼐、扎尔鼐等叛乱首领,阿尔布巴之乱遂平。
颇罗鼐取得了平叛战争的胜利,但也是元气大伤,此时清军主力也抵达拉萨,颇罗鼐非常恭顺地向大清帝国献上了降表,并发誓永远忠于大清帝国。雍正权衡利弊之下决定承认颇罗鼐的政治地位,正式册封颇罗鼐为贝子,后又晋封为郡王。同时任命噶西巴·纳木扎勒色布腾和策仁旺杰为噶伦,将西藏权力一分为三,并规定三人互不统属,直接对清廷负责。除了设置噶伦外,雍正还在拉萨设立驻藏大臣衙门,并以清廷要员僧格、马喇为驻藏大臣,让他们对颇罗鼐等3位噶伦进行直接监督,最重要的是,雍正还在拉萨留驻了2000名清军,他们由驻藏大臣直接指挥,成为大清帝国统治西藏最重要的武装力量。雍正的一系列措施,使大清帝国对西藏由之前的羁縻统治(间接统治)转而为实际控制(直接统治),西藏从此成为中华版图中牢不可破的一部分。